Dê o boot com o a mídia de instalação ou recuperação do Windows
Pressione uma tecla caso seja solicitado.
Selecione teclado e idioma e clique em "Avançar".
Na próxima tela clique em "Reparar o computador" \ "Solução de Problemas" \ Opções avançadas \ Prompt de comando.
Digite diskpart e pressione ENTER para entrar no diskpart
Dentro do diskpart digite list disk para listar os discos conectados ao computador.
Digite select disk mais o número do disco onde fica o Windows por exemplo: Select disk 0 (onde 0 é o disco que você quer selecionar)
Digite list volume para mostrar os volumes
Memorize a letra de unidade da partição do Windows e de seu pendrive (backup)
Especifique o seguinte comando: bcdedit /export F:\md\backup\BCD\PC\boot
Onde F:\md\backup\BCD\PC é o caminho para onde desaja salvar e "boot" é o arquivo de configuração de boot.
Volte ao diskpart
Selecione o disco onde está o Windows select disk 0
Selecione a patição EFI (Ela tem apróximadamente 100 MB e esta no formato de sistemas de arquivos Fat32)
ex: list partition
select partition 2 (onde 2 é a sua partição EFI) delete partition override
Crie uma nova partição EFI e atribua uma letra a ela: create partition efi format quick fs=fat32 assign letter=s (onde s pode ser qualquer letra a sua escolha)
Saia do diskpart exit
Agora vamos gravar novos arquivos de boot na partição EFI: bcdboot c:\windows /f UEFI /s s: (onde s: é letra que você atribuiu a partição EFi)
Use o comando bootrec para adicionar entradas ao arquivo de configuração de boot: bootrec /rebuildbcd
Agora digite exit para sair do prompt de comando e reinicie o Windows.